L'orgue à Saint-Etienne-de-Baigorry a été construit en 1999. Il s'agit d'un orgue de deux claviers de 56 notes, un pédalier de 30 notes et 28 registres. 

Il s'inspire des instruments construits au début du 18ème siècle dans le sud de l'Allemagne. Cet instrument a été créé par l'atelier Rémy MAHLER, installé à Pfaffenhoffen (Alsace). Sa construction a représenté sept années de mobilisation de l' Association qui a mené ce projet, et environ une année de travail pour cette équipe d'une dizaine de personnes.

L'instrument a été inauguré en Décembre 1999, après avoir eu l'honneur d'être exposé en Avril 1999 au Salon de la Musique de Paris -Musicora-.